La tradizione vuole che fosse esperto nella medicina ancora prima di diventare vescovo e che vivesse in una grotta tra le montagne, volontariamente, forse per sfuggire alle persecuzioni contro i cristiani. Nella grotta era avvicinato dagli animali selvatici che lui ammansiva e curava.

Alcuni cacciatori lo arrestarono e lo portarono al governatore Agricolao. San Biagio professò la sua fede in Cristo davanti a lui e perciò fu picchiato con le verghe. Poi appeso, stirato e gettato in prigione. Mentre lo portavano in prigione lo seguirono sette donne che professavano Gesù Cristo come vero Dio e per questo furono decapitate. Fu torturato con pettini che strappavano la carne, come quelli usati per cardare la lana:  'Dilacerato corpore, infractus animo resistit' secondo il racconto del suo martirio.

Durante la sua prigionia guarì un ragazzo che rischiava di morire soffocato a causa di una lisca conficcatasi in gola.

Si racconta anche che convinse con la sua parola un lupo a restituire un maiale che apparteneva ad una povera donna. Essa poi ricambiò il santo infiltrandosi nella prigione e portandogli cibo e candele. Fu gettato in fondo al lago, ma due angeli lo riportarono sano e salvo a riva, quindi fu decapitato. Furono decapitati anche due ragazzi che erano in prigione con lui e che egli aveva istruito alla religione cristiana.

San Biagio fu l'esecutore del testamento scritto di Sant'Eustrazio, quando questi fu martirizzato, e ciò è raccontato nella vita dei 'cinque martiri' venerati il 13 Dicembre dalla chiesa ortodossa. Compare in una antica tela, rappresentato tra i cinque martiri, vicino ad Eustrazio nell'atto di accettare dalle sue mani il testamento scritto.

Il martirio del Vescovo di Sebaste avvenne nel 315 o 316 d.C. durante l'impero di Licinio. Nel martirologio di San Gerolamo (347-419) non è nominato, ma in quelli europei del IX secolo San Biagio è nominato al 15 Febbraio, mentre in quelli greci è ricordato l'11 Febbraio. I pochi fatti certi sulla vita di San Biagio sono riportati nei documenti antichi frammisti alla leggenda che si diffuse a partire dall'ottavo secolo.

La venerazione del santo orientale è arrivata in Europa in tempi molto antichi e fu molto popolare nel Medio Evo. La ragione vera della devozione a San Biagio non è ancora stata chiarita. Innumerevoli chiese sono dedicate a lui e molte località ritengono di avere sue reliquie (Taranto, Ragusa, l'Abbazia di San Biagio nella Foresta Nera, e anche San Biagio di Callalta).

San Biagio si festeggia il 3 Febbraio nella chiesa cattolica e l'11 Febbraio nella chiesa orientale. E' rappresentato spesso con in mano due candele incrociate o in una grotta attorniato dagli animali. San Biagio è il patrono degli animali selvatici, dei cardatori e di tutte le persone che soffrono di malattie alla gola. In Germania, Svezia ed Ungheria San Biagio è venerato tra i 14 santi ausiliatori cui si rivolgono i devoti che chiedono aiuto in caso di malattia.